In themenbezogenen Arbeitsgruppen entwickeln und realisieren interessierte Akteure aus Verwaltung, Wirtschaft, Kultur und Wissenschaft konkrete Projekte der Zusammenarbeit. Die AGs sind für alle Interessenten in der Metropolregion Mitteldeutschland offen. Derzeit sind folgende AGs tätig:

Die AG "Wirtschaft und Wissenschaft" beschäftigt sich aktuell mit der Entwicklung eines gemeinsamen Messekonzeptes, der Ent-
wicklung des Fachkräftepotentials in der Metropolregion sowie der Präsentation der Metropolregion Mitteldeutschland 2009/2010 in Brüssel und Straßburg. Die AG wird gemeinsam durch die Städte Halle und Jena koordiniert.

Die AG "Verkehr" entwickelte 2007 eine Prioritätenliste der Ver-
kehrsvorhaben der Länder und des Bundes, deren Entwicklung ent-
scheidend für die Qualität der Infrastruktur der Metropolregion sind. Betreut wird die AG durch die Stadt Halle.

Die AG "Kultur und Tourismus" erarbeitete 2008 eine Broschüre, welche die Sehenswürdigkeiten in der Metropolregion Mitteldeutschland und ihrer Partner vorstellt. Mitte Nobember 2009 soll im Rahmen einer Konferenz diskutiert werden, inwieweit die Kultur- bzw. Kreativwirtschaft Impulse für die Entwicklung in der Metropolregion setzen kann. Die AG wird durch die Stadt Dresden koordiniert.

Die AG "Überregionale Kooperation" hat 2008 ihre Arbeit aufgenommen. Sie wird die Handlungsfelder und –möglichkeiten für die Einbindung der bestehenden regionalen Initiativen und Akteure aus den Stadt- und Teilregionen in die Arbeit der Metropolregion identifizieren und weiterentwickeln.